 |  |  |  |  |
Как стало известно: более 20% генетических вариантов, обнаруженных у болгар — уникальны.
Как сообщает bg-24.com, более 20% генетических вариантов, обнаруженных у болгар — уникальны.
Исследование выявило генетические особенности населения Болгарии
Первое масштабное исследование генома жителей Болгарии принесло важные результаты для науки и здравоохранения. Более одной пятой выявленных генетических вариантов ранее не были известны мировой науке.
В рамках пилотного проекта «Геном Болгарии» специалисты провели полное высокоточное секвенирование генома почти 800 добровольцев. В результате анализа обнаружили более 43,4 млн генетических вариантов. Из них свыше 8,8 млн, или ровно 20,3%, отсутствуют в международной справочной базе данных gnomAD.
Такие результаты свидетельствуют о генетических особенностях населения страны, которые невозможно точно оценить, опираясь исключительно на зарубежные эталонные данные. Эти различия могут иметь значение для предрасположенности к заболеваниям, реакции организма на лекарства и выбора методов лечения.
Результаты представила биоинформатик Цветана Керелска, руководитель проектов Центра молекулярной медицины Софийского медицинского университета. Доклад прозвучал на ежегодной конференции фонда «МОСТ — СМИ, общество, семья, технологии».
Полное секвенирование позволяет изучить весь геном
Обычные генетические тесты анализируют лишь отдельные участки генетического материала человека. Полное секвенирование позволяет исследовать всю ДНК, включая области между генами, которые при стандартных обследованиях часто остаются без внимания.
Для понимания биологического значения обнаруженных изменений важно учитывать, что почти 99% выявленных вариантов находятся в некодирующих участках ДНК. Эти области участвуют в регулировании активности генов. Только 0,8% вариантов расположены непосредственно в участках, отвечающих за кодирование белков.
Чуть более 34% обнаруженных вариантов встречаются исключительно редко, 15% относятся к редким, а 29% — к распространенным.
По мнению исследователей, полученные результаты подтверждают необходимость создания национальной справочной базы генетических данных. Она могла бы стать основой для более точной диагностики и персонализированного лечения.
Генетический вариант не всегда означает заболевание
Термины «мутация» и «генетический вариант» обозначают изменение последовательности ДНК по сравнению с условным эталонным геномом. В современной науке все чаще используют понятие «генетический вариант», поскольку слово «мутация» исторически ассоциировалось преимущественно с повреждениями и заболеваниями.
Однако большинство изменений ДНК не представляет угрозы для здоровья. Они определяют индивидуальные особенности человека, например цвет глаз или скорость обмена веществ. Клинический риск возникает в случае патогенных вариантов, которые нарушают нормальную работу определенных генов.
Исследование также выявило заметную распространенность скрытого носительства генетических изменений, связанных с серьезными заболеваниями. При этом наличие такого варианта не означает, что человек болен.
При аутосомно-рецессивном наследовании здоровый носитель имеет только одну измененную копию гена и обычно не испытывает никаких проблем со здоровьем. Заболевание может развиться у ребенка, если оба родителя являются носителями патогенного варианта одного и того же гена и передадут ему измененные копии.
У жителей Болгарии выявлено распространенное носительство наследственных заболеваний
Наиболее часто в исследуемой группе встречалось скрытое носительство вариантов гена ABCA4, связанных с нарушениями зрения. Такие изменения обнаружили у 8,5% участников.
На втором месте оказался ген CFTR, связанный с муковисцидозом. Его варианты выявили почти у 7% добровольцев. Этот показатель заметно превышает общеевропейские и мировые оценки, согласно которым распространенность такого носительства составляет около 4%.
Также исследователи обнаружили:
— варианты гена GJB2, связанные с врожденной глухотой, — более чем у 4,3% участников;
— варианты гена PAH, отвечающие за предрасположенность к фенилкетонурии, — примерно у 4%;
— варианты гена CLCN1, связанные с врожденной миотонией, — примерно у 3%;
— варианты, связанные со средиземноморской лихорадкой и врожденными эндокринными нарушениями, — по 2,7%;
— варианты гена CHEK2, связанные с предрасположенностью к онкологическим заболеваниям, — у 2,5%;
— варианты гена HBB, связанные с бета-талассемией, — у 2,3%.
Географическая близость Болгарии к Средиземноморью может объяснять распространенность некоторых генетических вариантов, характерных для этого региона.
Обнаружены случайные генетические изменения, связанные с риском тяжелых заболеваний
Особое значение для медицины имеют так называемые случайные находки — генетические изменения, которые выявляют у здоровых людей в ходе обследования, хотя они могут указывать на повышенную вероятность развития заболеваний в будущем.
На онкологические заболевания приходится 27% всех случайно обнаруженных генетических рисков, связанных с наследственными заболеваниями с доминантным или рецессивным типом передачи.
В исследованных геномах выявили 19 случаев обнаружения патогенных вариантов в 15 ключевых генах. Среди них — BRCA1 и BRCA2, связанные с наследственной предрасположенностью к раку молочной железы и яичников. Также обнаружены варианты генов, связанных с серьезными врожденными сердечно-сосудистыми и метаболическими заболеваниями.
По словам Цветаны Керелской, создание национальной генетической базы позволит сэкономить драгоценное время пациентам с редкими заболеваниями и сформировать прочную основу для развития персонализированной медицины и национальных программ скрининга.
Добровольцам сообщат о выявленных рисках при определенных условиях
Участие в исследовании может иметь практическую пользу и для самих добровольцев. В медицинской генетике существуют рекомендации относительно того, какие случайно обнаруженные изменения необходимо сообщать обследуемым.
Речь идет более чем о 80 генах. В их число входят гены, связанные с наследственными онкологическими заболеваниями, в частности раком молочной железы, яичников и толстой кишки, а также с некоторыми сердечными заболеваниями.
Исследователи обязаны сообщить участнику о выявленном генетическом варианте, если он связан с заболеванием, которое можно предотвратить, для которого существует лечение или которое отличается особой тяжестью.
Однако такая информация передается исключительно лично и только в том случае, если доброволец заранее выразил соответствующее желание в документе информированного согласия.
Генетические данные участников защищены кодированием
Для научного анализа и формирования справочных генетических баз данные участников кодируются с помощью процедуры, называемой псевдонимизацией.
Это означает, что личные сведения человека, включая имя, адрес электронной почты и клиническую информацию, хранятся отдельно от его генетических данных.